Nació en el distrito de San Juan, Departamento de Ñeembucú. Se graduó en Economía en la Universidad Nacional de Asunción, siendo dirigente gremial en la universidad y en el Centro Ignacio  A. Pane, donde inició su activa vida política. En 1992 fue electa como Convencional Constituyente, participando, integrando y promoviendo la Interbancada de Mujeres que tuvo a su cargo el impulso y la redacción de importantes artículos constitucionales, entre los que se destacan el artículo 46, 47, 48 y 117. En 1994, fue una de las promotoras de la creación de la Secretaría de la Mujer y designada como primera Ministra de la Mujer. Desde ese espacio promovió las primeras políticas de igualdad de género aprobando el I Plan Nacional de Igualdad de Oportunidades. Representó a Paraguay en reuniones y ante organismos internacionales, dejando una institución consolidada.  En su trayectoria política, Cristina Muñoz también fue electa como Senadora Nacional por la Asociación Nacional Republicana periodo 1998 – 2003, participando de importantes comisiones. En su labor docente, es profesora en las materias de Macroeconomía, Microeconomía, y Desarrollo Económico y Social, en la Facultad de Ciencias Económicas de la UNA. Actualmente, es presidenta en Ejercicio del Colegio de Graduados en Ciencias Económicas del Paraguay, además, es presidenta de la ERSSAN,  Ente regulador de servicios sanitarios del Paraguay.